动物造模,大肠内容物菌群 中国实验动物信息网 2021-10-19 989

　　目的：您想用高通量测序技术分析树鼩结肠细菌的结构和组成吗？

　　方法：采集三只雄树鼩大肠内容物，用细菌16SDNA通用引物扩增V3？用Illumina PE250平台进行V4区测序？

　　结果：共得到160157个有效序列，聚类后得到437个操作分类单元（OTU）。有9个Phlums，19个班级，37个命令和68个。鼩鼱大肠137种属194种细菌？其中，（1）Firmicutes 和 Proteobacteria 含量*多，分别为 63.30 28.52?（2）优势类是 Bacillus 和 γ? (51.46?8.02③乳杆菌和肠杆菌

　　目的：*丰富的45.33?27.51?④优势科为乳酸杆菌(35.30肠杆菌科(27.51⑤乳酸杆菌为前乳杆菌和大肠杆菌. (35.30?7.49在种水平上，可培养细菌的丰度为37.10?未分类细菌为27.69?未培养细菌为35.21?这八个未分类的物种（40?是从未被发现的新物种吗？个体之间的细菌群落是否存在一些差异？

　　结论：树鼩大肠内容物中细菌的组成是多种多样的。其中，还有许多相对丰富的细菌尚未分类或鉴定。