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【动物实验】-应用16S rRNA高通量测序法比较人与常用实验动物口腔菌群的异同

  目的:使用16SRNA高通量测序技术确定几种常用实验动物(西藏小猪,小猎犬,猕猴,新西兰兔,Wistar大鼠)的口腔菌群。与人类进行比较和分析。口腔微生态动物模型研究提供了基础数据。

  方法:使用一次性棉签收集来自藏族小型猪,小猎犬,猕猴,新西兰兔,Wistar大鼠和人类的一次性口腔拭子,从样品中提取总DNA,并标记通用引物使用Illumina对使用测序扩增16SRNAV4区的片段进行测序,并通过BIPES和QIIME进行分析,以比较菌群的多样性和结构。

  结果:人与五只常用实验动物之间的口腔菌群数量差异很大(P\u003c0.05)。尽管有些动物有自己独特的口腔菌群,但猴子的口腔菌群与人类的极为相似。

  结论:在五种动物中,根据它们与某些类型人类口腔菌群的相似性,猴子口腔中的梭菌和卟啉单胞菌的水平与人类*为相似。这表明猴子可能是研究人员模拟具有更适当口腔菌群的动物。从特定门的角度来看,藏族小型猪可能是更适合用于研究与蛋白细菌相关疾病的模型动物;比格犬是更适合用于研究与螺旋体相关疾病的模型动物。

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